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작성일 : 18-06-04 19:47
SELEX (Aptamer selection) 을 위한 제품안내
 글쓴이 : 관리자
조회 : 1,809  
   N2501_insert.pdf (119.8K) [5] DATE : 2018-06-04 20:16:03
   O-32001_PCROptimization.pdf (196.4K) [5] DATE : 2018-06-04 20:16:32
   https://www.trilinkbiotech.com/enews/140415_aptamer.asp [214]
   http://protein.bio.msu.ru/biokhimiya/contents/v72/full/72131505.html [269]

안녕하세요? 

 

미국 Trilink 사에서는 최근 기술동향으로

Target protein 에 binding affynity 를 갖고 있는 sequence 를 찾기 위한 방법으로

SELEX 실험관련법과 그에 따른 제품을 소개하고 있습니다.

 

최근에는 Aptamer 를 얻는 방법으로 SELEX 실험방법이 추천되고 있습니다.

Trilink 홈페이지의 아래 링크에서 SELEX 관련 update 를 확인하실수 있습니다.

https://www.trilinkbiotech.com/enews/140415_aptamer.asp

 

 

아래 Fig. 1 그림은

Aptamer 를 얻는 Scheme 을 알기쉽게 안내한 자료로

Biochemistry(Moscow), 2007, Vol. 72, No. 13, PP. 1505-1518에 발표된

A. V. Kulbachinskiy 논문(링크)으로 부터 인용된 것입니다.

http://protein.bio.msu.ru/biokhimiya/contents/v72/full/72131505.html

 

Aptamer- 01.png

 

 

SELEX 실험법에 필요한,

Trilink 사의 제품으로는

Catalog 번호 O-32001 제품이 있으며,

kit 내에 Randomized base 를 갖고 있는 Library Template와 PCR 증폭용 primer set 를 같이 제공하고 있습니다. 

Random sequence 사이즈는 20, 30, 40개로 세가지 사이즈가 있습니다.

첨부된 매뉴얼에는 세가지 사이즈에 따른 증폭된 PCR 결과 샘플도 있습니다.

 

               

좀더 자세한 내용으로,...

  

제품1. DNA Library (Cat #O-32001)

   :  SELEX 과정에 필요한 random libray 와 증폭용 primer set 로 구성되어 있습니다. 

   :  Library template 는 증폭에 필요한 fixed flanking primer binding site 를 양쪽에 포함하고 중간에는 무작위로(Randomized base)  20개 또는 30개와 40개의 base 로 구성된 것입니다.

   :  첨부된 PCR 매뉴얼 내용이 전체적으로 이해하시는데 도움이 되실것 같습니다.

 

Contains:

DNA Template (10 nmoles)
PO DNA, 5' TAG GGA AGA GAA GGA CAT ATG AT(N20, N30 or N40) TTG ACT AGT ACA TGA CCA CTT GA 3', N indicates A,C,G,T wobble site

 

Forward Selection Primer (20 nmoles)
PO DNA, 5' TAG GGA AGA GAA GGA CAT ATG AT 3'

 

Reverse Selection Primer (20 nmoles)
PO DNA, 5' TCA AGT GGT CAT GTA CTA GTC AA 3'

 

 

제품2. Biotinylated Primers (Cat #O-32202 & 32212)

  :  Selection 과정에서 amplicon capturing 을 쉽게하고자 Biotin label 된 forward & reverse Primer 가 별도 옵션으로 제공됩니다. 

 

5' Biotin Forward Selection Primer (20 nmoles)
PO DNA, 5' (Biotin BB™) TAG GGA AGA GAA GGA CAT ATG AT 3'

5' Biotin Reverse Selection Primer (20 nmoles)
PO DNA, 5' (Biotin BB™) TCA AGT GGT CAT GTA CTA GTC AA 3'

 

 

제품3. Mutagenesis dNTP Mix (Cat # N-2501)

:  Target Protein 과 결합력이 높은 Selection 위해서는  PCR 과정에 mutagenesis 를 유발시키는 경우도 종종 있습니다.

 :  첨부된 N-2501 kit 자료에 Random mutation PCR 을 위한 구성물과 Endpoint PCR protocol 자료가 있습니다.

 

 

 

=> 좀더 자세한 내용은 

본사 기술지원팀으로 문의해 주시기 바랍니다.

전화 02-477-7470

email : info@koreabiomics.com